广东省微生物种质资源库于2005年6月成立，由广东省科学技术厅、广州市科学技术局授牌，依托于广州市微生物研究所集团股份有限公司管理。

广东省微生物种质资源库保藏的微生物菌种有3000多株，覆盖普通微生物、工业微生物、检测微生物、益生菌微生物、药用微生物、海洋微生物等，种类类别齐全。 

本菌种库设施条件齐全，设备先进。建有菌种保藏室、菌种分离鉴定室、菌种制备室、菌种培养室、冷冻干燥室、菌种资料室及标本展览室等各功能室间；有用于菌种分离纯化、传代、冷冻干燥等专业菌种制备设备，如生化培养箱、显微镜及成像系统、厌氧培养箱、真空冷冻干燥机；有用于菌种保藏的设备，超低温冰箱、液氮罐、大型冷库等。 

本菌种库能为客户提供菌种鉴定、传代、制种、保藏等服务内容，能够根据客户需求订制服务内容。本菌种库常与科研院所、高校、企业及社会其他资源单位进行资源共享，为教学、科研和生产提供标准菌种、测试菌种及生产菌种，为社会提供相关服务。 

本菌种库长期跟国内外菌种保藏机构进行菌株交流合作，如美国典型培养物保藏中心（ATCC）、德国国家微生物菌种保藏中心（*Z）、中国普通微生物菌种保藏中心（CGMCC）、中国工业微生物菌种保藏中心（CICC）、中国医学微生物菌种保藏中心（CMCC）等多家保藏机构有合作交流，为华南地区高校院所，如中山大学、华南理工大学、华南农业大学、暨南大学、广东省农科院等提供过菌株服务。